I løpet av perioden folkemordet varte, gjorde et fåtall armenske områder motstand. Van var blant de steder hvor det lyktes å redde deler av den kristne befolkningen. Her pågikk det en motstandskamp fra 20. april til 6. mai 1915, da tyrkiske militære trakk seg tilbake. I Musa Dagh gjorde seks byer i nærheten av Middelhavet motstand, og etter 40 dager ble de evakuert av franske og britiske fartøyer.
Blant de steder der motstanden mislyktes, er Zeitun, som ble stormet 25. mars 1915, Shabin Karahisar, der det pågikk motstand 2.-30. juni 1915; og Urfa (bildet, fra 2006), der det var mostand fra 29. september til 20. oktober 1915. Gjennomgående kom den armenske motstanden i gang idet tyrkiske styrker hadde omringet et område.
