Internasjonal domstol

I 1999 startet forhandlinger mellom FN og Kambodsja om en domstol for å dømme de gjenlevende lederne i Røde Khmer. På grunn av Kinas mulighet til å nedlegge veto i Sikkerhetsrådet, måtte en domstol opprettes gjennom en avtale mellom FN og Kambodsja. Forhandlingene var krevende og lange, og preget av stor uenighet mellom partene. Kambodsja krevde å få et flertall av dommerne i domstolen. FN fryktet av dette ville føre til at den Kambodsjanske regjeringen i praksis ville kontrollere oppgjøret, siden det kambodsjanske rettsvesenet ble preget av korrupsjon og politisk kontroll. Avtalen mellom de to partene, som ble inngått i 2003, innebærer et flertall av kambodsjanske dommere, men en internasjonal dommer må delta i enhver beslutning.

De første tiltalene
Domstolen startet sitt arbeid i 2006, og de første høringene startet i 2007. Hittil er det tatt ut tiltale mot fem personer. Disse er Duch, eller Kang Kek Ieu, som var sjef på Tuol Sleng, og «Bror nummer to», alias Nuon Chea, dessuten Khieu Samphan, som var Røde Khmers offisielle statsoverhode og ansikt utad og utenriksminister Ieng Sary og hans kone Ieng Thirith, som var Røde Khmers sosialminister.

Ingen tiltale for folkemord
Ingen av disse lederne er tiltalt for folkemord. Dette har sin forklaring i folkemordkonvensjonens definisjon. Den krever at ofrene for folkemord tilhører en rasemessig, etnisk, nasjonal eller religiøs gruppe, og at ofrene er drept på grunn av sin tilhørighet til denne gruppen. Det er vanskelig å argumentere for at det store flertallet ofre, som var etniske khmer, ble drept fordi de tilhørte khmer-gruppen. Men det kan hende tiltalene kan utvides til å inkludere folkemord på de etniske minoritetene og religiøse ledere og munkestanden, siden disse ble forfulgt på grunn av sin tilhørighet til en gruppe som er beskyttet av folkemordkonvensjonen. Man kan muligens argumentere med at mange khmer ble drept fordi de tilhørte en sosial eller økonomisk gruppe, borgerskapet, men dette er et spørsmål domstolen altså har unnlatt å gå inn på.