Krigen i Bosnia tok slutt da en fredsavtale ble inngått i Dayton i USA i 1995. Dayton-avtalen slår fast at bosnjaker, serbere og kroater er tre likestilte grupper. Krigene har medført store endringer i bosettingsmønsteret. Det ble bestemt at Bosnia og Hercegovina skal bestå av to enheter: en serbiskdominert republikk kalt Republika Srpska fikk 49% av landområdet og den muslimsk-kroatiske Føderasjonen av Bosnia og Hercegovina fikk resten. De to enhetene skulle ha felles forsvar, utenrikspolitikk og rettsvesen. Avtalen sier at det skal være full bevegelsesfrihet for alle i hele staten, men slik er det ikke alle steder.